生物顯微鏡本質是光學放大設備，依靠光學成像放大樣本細節，供人眼觀察或數碼設備成像記錄，根據結構和用途主要分為以下類別：

按目鏡數量：分為單目、雙目、三目（三目可連接相機拍攝記錄，是目前科研教學主流）

按物鏡位置：分為‌正置生物顯微鏡‌（常規款，物鏡在載物臺上方，適合觀察玻片樣本）和‌倒置生物顯微鏡‌（物鏡在載物臺下方，適合觀察培養瓶中的活細胞）

按成像原理：分為光學生物顯微鏡（最大放大倍率約2000倍）和電子生物顯微鏡（最大放大倍率超300萬倍，可觀察細胞超微結構）

生物顯微鏡的物鏡和目鏡安裝：

安裝前準備：

先將顯微鏡主體平穩放置在實驗臺，取下目鏡和物鏡接口的防塵蓋，準備干凈的擦鏡紙備用；建議優先安裝放大倍數較低的目鏡和物鏡，方便后續對光和尋找觀察目標。

目鏡安裝（第一步）：

目鏡安裝在鏡筒頂端的目鏡接口處，多數生物顯微鏡為直插式設計：‌直接將目鏡尾部對準鏡筒接口輕輕插入到位即可‌，一般插到底后會有輕微卡扣固定，不需要旋轉擰緊。

如果是雙目/三目顯微鏡，將兩只目鏡按相同深度依次插入接口即可，后續可根據瞳距調整間距。

物鏡安裝（第二步）：

物鏡需要安裝在鏡筒下方的轉換器上，具體操作：

先將轉換器旋轉至空位，拿起物鏡，對準轉換器上的螺孔，‌順時針輕輕旋轉物鏡接口擰緊‌，直到手感穩固即可，不要用力過猛損傷螺紋。

按放大倍數從低到高依次將所有物鏡安裝到轉換器的對應螺孔中，安裝完成后輕轉轉換器，確認轉動順滑、沒有卡頓晃動。

如果使用的是快裝式轉換器，只需將物鏡對準卡口輕輕按入即可卡緊，無需旋轉擰緊。

安裝后檢查：

安裝完成后轉動轉換器，將低倍物鏡對準通光孔，檢查：物鏡中心與通光孔對齊、物鏡前端與載物臺能保持2cm左右距離，沒有接觸碰撞即為安裝正確。